Présentation:

Ce Grand Plateau Technique Régional fédère et coordonne l’activité de plusieurs plateaux techniques dédiés aux activités de génotypage dans le domaine de l’Agro-Biodiversité. Il regroupe des plateaux techniques de l'UMR AGAP membre du Labex Agro d’une part et d’autre part, de l’UMR ISEM membre du Labex CeMEB. Il apporte son soutien à tout programme de recherche de génétique moléculaire et génomique portant sur des espèces d’intérêt agronomique ou patrimoniale. Il offre des possibilités importantes de génotypage à l’aide de marqueurs moléculaires classiques tels que SSR et SNP mais aussi de génotypage par séquençage grâce aux techniques de séquencage NGS (Next Generation Sequencing), à moyen/haut débit. Il permet la construction, l’exploitation, et la gestion de ressources génomiques, en offrant des technologies d’élaboration de banques d’ADN diverses s’appuyant sur un plateau de robotique à haute productivité.

Le GPTR propose également une automatisation de l’extraction d’acides nucléiques de qualité génomique afin de traiter rapidement et de façon reproductible un grand nombre d’échantillons. Cette plateforme met également à disposition plusieurs  outils dédiés à la préparation de banques NGS.

Elle assure une veille technologique, l’accueil et la formation de nombreux personnels (étudiants, techniciens, chercheurs) issus des communautés scientifiques locale, nationale et internationale. Elle apporte enfin son expertise à la mise en place et à l’utilisation de technologies similaires dans d’autres sites.

Cette plateforme est constituée de 3 plateaux techniques, localisés sur 3 sites :

  • Le plateau "GenSeq" : Génotypage - Séquençage sur le campus Triolet de l’université de Montpellier.
  • Le plateau de génotypage du Cirad sur le campus de Lavalette
  • L'atelier de marquage moléculaire INRA/Supagro situé sur le campus Supagro de la Gaillarde

Conditions d'utilisation:

Une première rencontre entre le personnel Plateau et l'équipe scientifique intéressée permet d'évaluer la faisabilité du projet à réaliser. Une présentation et une formation des techniques mises en œuvre sont proposées en début d'accueil.

Des conseils permanents sont communiqués afin d'optimiser les expériences et obtenir des résultats optimaux. Suivant les projets, le personnel dédié peut apporter un appui technique et un suivi scientifique (informatique, bio-technologique, organisation et interprétation des données…).

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